Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpf2Q9JJ80 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpf2Q9JJ80 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms