Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc22Q9JIG7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms