Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3r2Q9JHL1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc9a3r2Q9JHL1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms