Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn19Q9ET38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn19Q9ET38 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn19Q9ET38 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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