Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm7Q9ESD6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmtm7Q9ESD6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms