Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ParvbQ9ES46 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms