Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r48Q9EQ52 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms