Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xab2Q9DCD2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms