Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzd9Q9D9M4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzd9Q9D9M4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms