Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timm50Q9D880 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm50Q9D880 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms