Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms