Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2cQ9D1C1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2cQ9D1C1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms