Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ChtopQ9CY57 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms