Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ist1Q9CX00 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms