Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smurf1Q9CUN6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms