Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9CRC3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9CRC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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