Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpidQ9CR16 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms