Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms