Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms