Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmp1Q99KU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms