Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab28Q99KL7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab28Q99KL7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms