Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pls3Q99K51 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pls3Q99K51 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms