Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms