Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Afg3l1Q920A7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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