Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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