Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc59Q8R2N0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms