Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg10Q8R1P4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms