Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ctxn1Q8K129 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctxn1Q8K129 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms