Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms