Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnl3Q8CGK6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms