Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacnb2Q8CC27 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb2Q8CC27 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms