Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef2Q8C9J3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms