Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms