Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg16l1Q8C0J2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms