Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx16Q8C080 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Snx16Q8C080 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Snx16Q8C080 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Snx16Q8C080 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx16Q8C080 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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