Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps6ka5Q8C050 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka5Q8C050 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms