Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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