Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan9Q8BJU2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms