Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco3Q8BH01 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms