Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vipas39Q8BGQ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms