Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Cpped1Q8BFS6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cpped1Q8BFS6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cpped1Q8BFS6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cpped1Q8BFS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cpped1Q8BFS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpped1Q8BFS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms