Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sestd1Q80UK0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms