Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sdccag8Q80UF4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdccag8Q80UF4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms