Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg1bQ7TSF1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms