Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPN3

Pigv, GPI mannosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigvQ7TPN3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PigvQ7TPN3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PigvQ7TPN3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms