Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b3Q6UQ17 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Atp8b3Q6UQ17 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Atp8b3Q6UQ17 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Atp8b3Q6UQ17 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Atp8b3Q6UQ17 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Atp8b3Q6UQ17 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp8b3Q6UQ17 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms