Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Med16Q6PGF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med16Q6PGF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms