Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcd3Q6P9Z1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcd3Q6P9Z1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms