Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp2d40Q6P8N9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp2d40Q6P8N9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp2d40Q6P8N9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms