Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ino80dQ66JY2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms